כימיה כללית וכימיה אורגנית מס' קורס: 0162.1119 שיעור, 3 ש"ס מועד הקורס: שנה א' סמסטר א', יום א', 14:00-11:00 11:00-08:00, eshnit@post.tau.ac.il shemeshh@post.tau.ac.il מרצות: דר' אדית שניצר הדס שמש שעות קבלה: בתיאום מראש רציונל: הקורס מקנה הבנה וידע בסיסי בכימיה הכללית והאורגנית. ידע בסיסי זה נחוץ וחשוב ללימוד והבנה של קורסים מתקדמים במדעי הרפואה. מטרות הקורס: הכרת השפה הכימית הקנית ידע והבנה בכימיה כללית תוך הדגשה על הנושאים המיושמים במקצועות הרפואה הכרת תרכובות אורגניות כבסיס חשוב לביוכימיה העוסקת בכימיה של האורגניזם החי. שיטות הוראה: הרצאות, תרגילים נושאי השיעורים: כימיה כללית: מבנה האטום: פרוטון, ניוטרון, מספר אטומי, מספר מסה, מסה אטומית, איזוטופים, היערכות האלקטרונים באטום, יונים.
המערכה המחזורית: מתכות, אל מתכות, משפחות כימיות: מתכות אלקליות, הלוגנים, גזים אצילים. מצבי צבירה: מוצק, נוזל, גז, שינויי מצב צבירה, תהליך פיזיקלי. קשר כימי: קשר יוני: סריג יוני, נוסחה אמפירית, תכונות של חומרים יוניים, היתוך והמסה של סריגים יוניים, יונים מורכבים. קשר קוולנטי: קשר קוולנטי בודד, כפול ומשולש,מולקולה, נוסחה מולקולרית, נוסחאות מבנה, קשר קוולנטי קוטבי, אלקטרושליליות. סוגי חומרים: יסוד,תרכובת קשרים בין מולקולריים: קשרי מימן סטוכיומטריה : מול, מספר אבוגדרו, מסה מולקולרית, מסה מולרית. מים: מים, מסיסות במים, תערובות: תערובת הטרוגנית, תערובת הומוגנית, תמיסה, ממס, מומס, מים מזוקקים, מים מינרלים, מים סטריליים, מים קשים, מים רכים. ריכוזים: ריכוז מולרי, אחוז משקלי. תהליך כימי:תהליך כימי, תגובה כימית, חוק שימור החומר. אנרגיה: תגובה אקסותרמית ותגובה אנדותרמית, פרופיל אנרגיה של תגובה, מצב ביניים, אנרגית שפעול, קטליזטור. שיווי משקל: שיווי משקל כימי, תגובה ישירה, תגובה הפוכה, מצב שיווי משקל דינאמי, קבוע שיווי משקל, הפרעות לשיווי משקל. חומצות ובסיסים: חומצה, בסיס,תגובת יוניזציה של מים,,pH חוזק חומצה, תגובת סתירה, בופר. חמצון חיזור: מחמצן, מחזר, תגובת חמצון חיזור, דרגות חמצון. רדיואקטיביות: קרינת, ו, איזוטופים רדיואקטיביים, שימושים.
כימיה אורגנית: אלקאנים )פרפינים(: מבנה, איזומריה של מבנה, קבוצה אלקילית, תכונות פיזיקליות ותגובות אופייניות. אלקנים )אולפינים(: אי רוויון, איזומריה מרחבית )ציס/טרנס(, תכונות פיזיקליות ותגובות אופייניות, פילמור, מונומר, פולימר. תרכובות ארומטיות: בנזן כהלים: קבוצה פונקציונאלית, תכונות פיזיקליות, גליצרול. אלדהידים וקטונים: קבוצה פונקציונאלית, היווצרות מחמצון כהלים. חומצות קרבוקסיליות : קבוצה פונקציונאלית, תכונות פיזיקליות, תגובות אופייניות: תגובה עם מים, תגובה עם כהל ליצירת אסטר, היווצרות מחמצון אלדהיד. אמינים : מבנה, תגובה עם מים. חומצות שומן: סוגי חומצות שומן, סימון שמות. ליפידים: טריגליצרידים ( שומנים ושמנים(, פוספוליפידים וכולסטרול. סוכרים : חד סוכרים: איזומריה מרחבית, איזומריה אופטית, סגירת טבעת, דו סוכרים: קשר גלקוזידי, רב סוכרים: גליקוגן, עמילן וצלולוז.
חלבונים : חומצות אמינו, חומצות אמינו הכרחיות, קשר פפטידי, חלבון, מבנה ראשוני, שניוני, שלישוני ורביעוני של חלבונים, חלבון גלובולרי, חלבון סיבי, דנטורציה, קבוצה פרוסטטית, חלבונים מורכבים : גליקופרוטאינים וליפופרוטאינים. חומצות גרעין : נוקלאוטידים, פוספט, סוכר, בסיסים חנקניים, DNA וRNA הרכב ומבנה, שיכפולDNA. דרישות הקורס: הנוכחות חובה בכל השיעורים בהתאם לתקנון התוכנית. נוכחות בשיעורים היא תנאי להגשה לבחינה. פתרון תרגילים עמידה בבחינה מסכמת דרישות מוקדמות: אין ציון: בחינה מסכמת- 100% 60 לפחות. ציון עובר ספרות מומלצת: מנזורולה, ע. )1995(. עקרונות הכימיה.באר שבע, ישראל: קווים. צ'שנובסקי, ד. ) 2005 (.כימיה: עולם החומר.חולון, ישראל: דוד רכגולד ושות'. McMurry, J.E. (2011). Fundamentals of organic chemistry. (7th ed.). Belmont, CA : Brooks/Cole Petrucci, R.H., Herring, F.G., Madura,J.D. & Bissonnette, C. (2017). General chemistry : principles and modern applications. (11th ed.). Toronto, Canada:Pearson Prentice Hall
Lecture (3 semester hours) General chemistry and organic chemistry Course No. 0162.1119 Date of course: Year 1, 1st semester. Sunday,08:00-11:00, 11:00-14:00 Lecturers: Dr. Edit Schnitzer E-mail: eshnit@post.tau.ac.il Ms. Hadas Shemesh E-mail: shemeshh@post.tau.ac.il Office hours: By appointment only Rationale: The course provides students with basic knowledge and an understanding of general and organic chemistry. This basic knowledge is essential for learning and understanding advanced courses in the medical sciences. Goals of the course: To become familiar with the language of chemistry; To gain knowledge and understanding in general chemistry with an emphasis on subjects that are applied in the medical professions; To recognize organic compounds as an important foundation for biochemistry, which deals with the chemistry of living organisms. Teaching methods: Lectures, exercises Course topics: General chemistry:
Structure of the atom: Proton, neutron, atomic number, mass number, atomic mass, isotopes, how electrons are arranged in an atom, ions. The periodic table: Metals, nonmetals, chemical families alkaline metals, halogens, noble gases. States of matter: Solid, liquid, gas, transition from one state to another, physical change. Chemical bonds: Ionic bond: Lattice structure, empirical formula, characteristics of ionic compounds, melting and dissolving ionic lattices, complex ions. Covalent bond: Single, double and triple covalent bonds, molecule, molecular formula, structural formulae, polar covalent bond, electronegativity. Types of matter: Element, compound. Bonds between molecules: Hydrogen bonds. Stochiometry: Mole, Avogadro number, molecular mass, molar mass. Water: Water, solubility in water; solution, solvent, solute, distilled water, mineral water, sterile water, hard water, soft water; concentrations: molar concentration, weight percentage. Chemical process: Chemical process, chemical reaction, law of conservation of matter. Energy: Exothermic and endothermic reactions, energy profile of a reaction, intermediate state, activation energy, catalyst. Equilibrium: Chemical equilibrium, direct reaction, reverse reaction, dynamic equilibrium, equilibrium constant, equilibrium imbalance. Acids and bases: Acid, base, ionization reaction for water, ph, acid strength, neutralization, buffer.
Reduction-oxidation: Oxidant, reductant, redox reaction, degrees of oxidation. Radioactivity: Alpha, beta and gamma radiation, radioactive isotopes and their uses. Organic chemistry: Alkanes (paraffins): Structure, isomers, alkyl group, physical characteristics and typical reactions. Alkenes (olefins): Unsaturation, cis and trans isomers, physical characteristics and typical reactions, monomer, polymer. Aromatic compounds: Benzene. Alcohols: Functional group, physical characteristics, glycerol. Aldehydes and ketones: Functional group, formation from oxidation of alcohols. Carboxylic acids: Functional group, physical characteristics, typical reactions: reaction with water, reaction with alcohol to form esters, creation from oxidation of aldehydes. Amines: Structure, reaction with water. Fatty acids: Types of fatty acids, nomenclature. Lipids: Triglycerides (fats and oils), phospholipids and cholesterol. Carbohydrates (sugars): monosaccharides: optical isomers, closing the ring; disaccharides: glycosidic bond; polysaccharides: glycogen, starches and cellulose. Proteins: Amino acids, essential amino acids, peptide bond, protein, primary, secondary, tertiary and quaternary structure of proteins, denaturation, glycoproteins and lipoproteins. Nucleic acids: Nucleotides, phosphate, sugar, nitrogenous base, composition and structure of DNA and RNA, replicating DNA.
Course requirements: Participation in classes. Students may be absent in up to 20% of classes (including justified absence). Completion of exercises Passing the final examination Prerequisites: Attendance is mandatory. Presence is a prerequisite for the final exam. Grade: Final examination 100% Passing grade minimum of 60. Recommended reading: Cheshenovsky, D. (2005). Chemistry: The world of matter. Holon, Israel: David Rechgold And Co. (in Hebrew). Manzorola, E. (1995). Principles of chemistry. Beersheva, Israel: Kavim. (in Hebrew). McMurry, J.E. (2011). Fundamentals of organic chemistry. (7th ed.). Belmont, CA : Brooks/Cole Petrucci, R.H., Herring, F.G., Madura,J.D. & Bissonnette, C. (2017). General chemistry : principles and modern applications. (11th ed.). Toronto, Canada:Pearson Prentice Hall