הקורס בבקטריולוגיה ומיקולוגיה וטרינרית

תמליל

1 :Escherichia coli תכונות Escherichia coli הוא חיידק בעל תכונות טיפוסיות לחיידקי ה- enterobacteriaceae. בניגוד לחיידקי הסלמונלה הם מתסיסי lactose ויוצרים.indole

2 :Escherichia coli אנטיגנים וסיווג ה- serotype של חיידקי.E coli נקבע על פי 4 קבוצות אנטיגניות: אנטיגנים סומאטיים הקשורים ב- lipopolysaccharide של דופן התא )כ- 181 סוגים(. :O אנטיגן פלגלארי, חלבוני )כ- 53 סוגים( H: אנטיגן קפסולארי, פוליסכריד )כ- 80 סוגים( K: אנטיגן פימבריאלי, חלבוני )כ- 20 סוגים(. מספר אנטיגנים פימבריאליים נחשבו בעבר כאנטיגנים קפסולאריים וקבלו לכן כינויים כגון K88 ו- K99. אנטיגנים אלה נקראים היום F4 ו- F5 בהתאמה. :F יותר מסוג אחד של אנטיגן זה יכול להימצא על חיידק בו זמנית. לכל זן.E coli נוסחה אנטיגנית הכוללת את האות המסמנת את הקבוצה ומספר O157:K82:H7:F4( למשל(. מוכרים כ סרוטיפים של.E coli אך רק מספר עשרות מהם מעורבים בתופעות קליניות.

3 :Escherichia coli סביבת חיים חיידקי.E coli מהווים חלק מהפלורה המיקרוביאלית הטבעית במעי של בעלי חיים, נפוצים בסביבתם ומקורם בזיהום צואתי. ביכולתם לשרוד )בתנאים מתאימים( שבועות וחודשים בסביבה.

4 סיווג ברמה מתחת למין (species) Serotype: differences in antigenic formula Biotype: differences in biological characteristics (metabolism, growth conditions etc). < subspecies Pathotype: differences in pathogenesis and pathology

5

6 Pathotypes: Enteric ETEC: Enterotoxigenic E. Coli EPEC: Enteropathogenic E. coli EIEC: Enteronivasive E. Coli VTEC/STEC/EHEC: Verotoxigenic/Shigalike toxin producing/enterohemorrhagic E. coli. AEEC: Attaching-effacing E. coli = EPEC + VTEC

7 Pathotypes Extraintestinal (expec) UPEC: Uropathogenic E. coli NMEC: Neonatal Meningitis-causing E. coli APEC: Avian pathogenic E. coli

8 Escherichia coli - pathotypes Diffusely adherent Uropathogenic Enteropathogenic Attaching-effacing Enterohemorrhagic Enteroaggregative Shiga-like toxigenic Enterotoxigenic Enteroinvasive

9 :Escherichia coli גורמי אלימות Capsule Lipopolysaccharide

10 גורמי אלימות - פילי :Escherichia coli פילי שמעוכבים וכאלה שאינם מעוכבים על ידי -D לקבוצה זו שייכים פילי מסוג,Type 1.manose המיוצרים על ידי מרבית זני.E coli בין אם הם פתוגניים ובין אם לא. הם ארוכים יחסית )2 מיקרון(. להם משמעות פתוגנית בדלקות בדרכי השתן אך לא בפגיעות בדרכי העיכול. יש.1

11 גורמי אלימות - פילי :Escherichia coli על חיידקי.E coli אנטרוטוקסיגנים :(ETEC) פילי מסוג F4 )לשעבר K88(: מיוצר ב- 37 מעלות בלבד ומאפשר את הצמדות חיידקי.E coli אנטרוטוקסיגנים לרירית המעי של חזירונים, בהם הוא גורם לשלשולים. קיימים 3 סוגי פילוס: F4 a,b F4 a,c F4 a,d המידע התורשתי ליצירת הפילוס נמצא על פלסמיד.

12 גורמי אלימות - פילי :Escherichia coli קיימים הבדלים גנטיים ברגישות חזירונים לחיידקי.E coli F4 חיוביים ומבדילים ב- 5 פנוטיפים: רגישים לכל הפילי רגישים ל- 2 מתוך השלשה )2 פנוטיפים( רגישים לסוג אחד עמידים חלק מחיידקי.E coli F4 הם פולשניים )invasive( וניתן לבודדם מאברי החזירונים הנגועים.

13 גורמי אלימות - פילי :Escherichia coli פילי מסוג F5 )לשעבר K99(: תכונות דומות ל- F4 אך הוא פוגע בעיקר בעגלים בני מספר שעות. מעורבותם של פתוגנים אנטריים אחרים עלולים להאריך את משך רגישותו של העגל לחיידק. חיידקי E. coli F5 אינם פולשניים

14 גורמי אלימות - פילי :Escherichia coli פילי מסוג F6 )לשעבר P987(: מופיעים על חיידקי.E coli שבודדו בעיקר מחזירים )לפעמים יחד עם פילי מסוג F4( ולעתים רחוקות יותר גם מעגלים. קשה ביותר לגלותם על חיידקים בתרבית. פילי מסוג F41: מופיעים על חיידקי.E coli שבודדו הן מבקר והן מחזירים, לבד או יחד עם פילי אחרים.

15 גורמי אלימות - פילי :Escherichia coli 4 פילי מסוג F17: סוגים נמצא ב- ETEC F17a F17b נמצא בבידודי.E coli המעורבים במצבי אלח בעגלים וטלאים E. coli נמצא בבידודי )K20 )לשעבר F17c המעורבים בשילשולים ומצבי אלח בעגלים ופגיעות כליתיות בטלאים ובזיהומי דרכי השתן בבני אדם )לשעבר נמצא ב- ETEC בבקר )F111 F17d

16 גורמי אלימות - פילי :Escherichia coli על חיידקי.E coli אנטרוטופטוגניים :(EPEC) IV) :(bfp, type פילי הנוטים להתאגד. Bundle forming pili גמישים ובעלי יכולת הסגה )retraction( כך: דרך דופן התא. ע"י מקנים ניידות לחיידקים חסרי שוטונים מצמידים חיידקים זה לזה ליצירת מיקרו-מושבות המקנות הגנה, בדומה לרבדים הביולוגיים, מסביבה עוינת. מעורבים גם בתהליך ההצמדות של קבוצת חיידקים זו לריריות המעי

17

18 גורמי אלימות - פילי :Escherichia coli על חיידקי.E coli אנטרואגרגטיביים :(EAEC) :Aggregative adherence fimbriae סוג מיוחד של bundle forming pili המאפיינים.EAEC קיימים שני סוגים של פילי אלה: AAF/I ו- AAF/II

19 גורמי אלימות - פילי :Escherichia coli פילי הקשורים לזנים מסוימים של.E coli שבודדו בשלשול שלאחר גמילה בחזירים O-( O-25, O-108, O-138, O-139, O-157 )141, O-147, ומחלת הבצקות disease( )edema בחיות אלה.)O139:K12:H1( קיבל את הכינוי F18 )לשעבר F107(. :curli על זנים מסוימים של.E coli אשר בודדו ממקרי דלקת עטין בבקר נראו פילי "מטולטלים" הנקשרים לפיברונקטין. משמעותם כגורם אלימות אינה ידועה.5.6

20 גורמי אלימות - פילי :Escherichia coli :Colonization Factor Antigens I and II קשורים לזנים הומאניים של.ETEC הם hemaglutinins יציבי.mannose

21 :Escherichia coli גורמי אלימות מנגנוני הצמדות אחרים outer membrane protein ( חלבון מעטפת תא :Intimin (E. coli attaching and המקודד על ידי הגן )- OMP effacing) eae (EPEC, VTEC) משותף לכל החיידקים המעורבים בתופעה Locus of Enterocyte הגן נמצא על אי אלימות Effacement (LEE)

22 :Escherichia coli גורמי אלימות מערכות הפרשה מטיפוס II מעורבים בתהליך ה- attachment intimate נמצאים E. coli אנטרוהמורהגים (EHEC) בחיידקי זוהו 6 איי אלימות אשר פעילותם לא הובהרה עדיין אך נראה שבין היתר הם אחראים לעיכוב הפרשת חלבונים ויישוב הריריות.

23 :Escherichia coli גורמי אלימות מערכות הפרשה מטיפוס III קשורות לאי האלימות חלבוני effector LEE אשר מקודד לפחות 7 (EPEC) אנטרופתוגנים E. coli (EHEC) אנטרוהמורהגים E. coli (EIEC) אנטרואינבזיביים E. coli נמצאים ב: חיידקי חיידקי חיידקי

24 :Escherichia coli אנטרוטוקסינים גורמי אלימות אנטרוטוקסינים מיוצרים על ידי חיידקי.E coli אנטרוטוקסיגנים.)ETEC( המידע התורשתי ליצירת אנטרוטוקסינים פלסמידים. נמצא בדרך כלל על מבדילים בשתי קבוצות של אנטרוטוקסינים:

25 :Escherichia coli אנטרוטוקסינים גורמי אלימות רעלנים בינאריים עמידים לחום stable( :)ST, heat העמידות נובעת ממספר רב של פרודות ציסטאין היוצרות קשרים דו-גופרתיים ביניהם. קיימים שני סוגי רעלנים יציבי חום: ו- STb : STa

26 :Escherichia coli אנטרוטוקסינים גורמי אלימות רעלני :STa מסיסים במטנול גורמים להצטברות נוזלים במעי של עכברים יונקים. מיוצרים על ידי זני.E coli המבודדים מבני אדם, חזירים ובקר

27 :Escherichia coli פעילות הרעלן: העלאת רמת הפעילות של האנזים guanylate cyclase הנמצא בחלק העליון של תאי אפיתל המעי יצירה מוגברת של cyclic guanidine monophasphate (cgmp) cgmp מצמצם ספיגת יונים + ו- - Cl ) מהמעי ומגביר Na( הפרשת - Cl מתאי האפיתל לחלל המעי. שינויים אלה מלווים בירידה בספיגת נוזלים ובהגברת הפרשתם לחלל המעי בהתאמה, עקב לחצים אוסמוטיים, ולשלשול. גורמי אלימות אנטרוטוקסינים

28 :Escherichia coli אנטרוטוקסינים גורמי אלימות רעלני :STb פוליפפטידים אשר אינם מסיסים במטנול אינם גורמים להצטברות נוזלים במעי של עכברים יונקים. מיוצרים.E coli המבודדים מחזירים על ידי זני פעילות הרעלן: הגברת יצירת פרוסטגלנדין E2 הגברת ההפרשה של ביקרבונאט לחלל המעי פגיעה בתאי אפיתל המעי והתנוונות ה- vili.

29 :Escherichia coli אנטרוטוקסינים גורמי אלימות רגישים לחום labile( :)LT, heat רעלנים אלה הם חלבונים הדומים במבנה ובפעולה לרעלן הכולירע המופרש ע"י Vibrio cholerae אך יש מספר הבדלים: ב- coli.e הגנים על פלסמיד הרעלן של.V cholerae פועל גם על העצבים במערכת העיכול ב- coli.e רק כ- 10% מהרעלן מופרש, היתר נאגר בחיידק. כתוצאה מכך השלשולים הנגרמים ע"י חיידקי ETEC קלים בהרבה מאלה שנגרמים ע"י.V cholerae אין להם כנראה תפקיד כגורם שילשולים בעגלים

30 :Escherichia coli אנטרוטוקסינים גורמי אלימות רעלני :LT-I רעלני LT-I מיוצרים על ידי זני.E coli המבודדים מבני אדם וחיות הרעלן המורכב מתת יחידה A ו- B. חמש יחידות GM 1 ויוצרים מעין צינור B נקשרות לקולטן דרכו עוברת יחידה A, האחראית לפעילות הרעלן.

31 :Escherichia coli גורמי אלימות אנטרוטוקסינים פעילות הרעלן: העלאת רמת הפעילות של האנזים adenylate cyclase בחלק התחתון של תאי אפיתל המעי ליצירה מוגברת של (camp) cyclic adenosin monophasphate - Cl גורם להפרשה מוגברת של camp מהתאים לחלל המעי או חסימת קליטת מלח לתוך התאים הנוזלים המופרשים יחד עם יונים אלה עקב לחץ אוסמוטי גורמים להופעת השלשולים לא מן הנמנע כי הרעלן פועל גם בדרכים נוספות

32 :Escherichia coli אנטרוטוקסינים גורמי אלימות רעלני LT-II רעלני פועלים בצורה דומה ל- LT-I in-vitro LT-II מבנה תת היחידה B שונה.GD 1 הקולטן שונה: אין הוכחה למעורבותו בתופעות קליניות

33 :Escherichia coli גורמי אלימות רעלנים אחרים רעלני EAST-1 אנטרוטוקסינים המיוצרים על ידי: Shiga toxin-producing E. coli (STEC) (EAEC) Enteroaggregative E. coli לחום עמידים מעורבים ככל הנראה בשלבים הראשונים, הלא דמיים, של השלשולים הנגרמים על ידי קבוצות חיידקים אלה

34 :Escherichia coli רעלנים אחרים גורמי אלימות Verotoxins/Shiga like toxins רעלנים דו-חלקיים רגישים לחום שמם של רעלנים אלה נובע מיכולתם לפגוע בתאי VERO ומדמיונם לרעלנים המופרשים על יד חיידקי Shigella dysenteriae 1 ממנו הם נבדלים בחלבון אחד בלבד ביחידה B. קיימים שני סוגי רעלנים בקבוצה זו: Stx1 )נקראים גם Vt1 ו- Vt2 (. ו- Stx2

35 :Escherichia coli גורמי אלימות רעלנים אחרים Verotoxins/Shiga like toxins קיים מגוון רעלני.Stx2 שמור, בזמן ש- Stx1 Stx2 מופרש בזמן ש- Stx1 נאגר בחיידקי כל עוד הוא חי תת סוג של Stx2 מעורב במחלת הבצקות בחזירים. נראה כי תרופות אנטיבקטריאליות מסוימות, ביניהם כאלה המשמשים לטיפול במחלות מעיים ( furans, quinolones,,)trimethoprim משרים הגברת ביטוי הגן. הרעלנים פועלים ע"י: פגיעה בקשירת amino-acyl-trna לריבוזומים עיכוב בתהליך יצירת החלבונים בתא מות התא

36 :Escherichia coli גורמי אלימות רעלנים אחרים Verotoxins/Shiga like toxins מקור חלק מרעלני ה- Stx החיידק. הוא פאז' שעבר הכללה בגנום של הפאז'ים המשולבים בגנום החיידקים ומשתכפלים כל פעם שהחיידק מתחלק )מצב ליזוגני(. במצבים מסויימים ביניהם כאלה בהם החיידק נכנס לעקה, הפאז' עובר למעגל ליטי בו הוא משתחרר מהגנום החיידקי, מתרבה, הורס את התא ומשתחרר.

37 :Escherichia coli רעלנים אחרים גורמי אלימות Verotoxins/Shiga like toxins הנגיף יכול להדביק חיידקי חופשי מצואה או הסביבה..E coli אחרים ו/או להשאר בסקרים אכן נמצאו פאז'ים עם מידע תורשתי לרעלני,Stx בעיקר,Stx2 חופשיים בצואה וסביבה מזוהמת בזיהום צואתי של בני אדם וחיות.

38 :Escherichia coli גורמי אלימות רעלנים אחרים נמצא כי הפאז'ים עמידים יותר מהחיידקים בסביבה, לטיפולים שונים שעוברים מוצרי מזון )חימום, ייבוש, קרינה(, לחומרים שונים כגון חומרי חיטוי ולתכשירים אנטיבקטריאליים. למצב זה מספר השלכות: מספר גדול של פאז'ים נמצאו על מוצרי מזון שנמצאו ראויים למאכל אדם מבחינה מיקרוביאלית. במערכת העיכול פאז'ים אלה יכולים לחדור לחיידקי.E coli ולהפוך אותם ליוצרי רעלני.Stx בסקרים לנוכחות חיידקי.E coli יוצרי רעלני Stx המבוססים על זיהוי גנים ליצירתם, ייכללו הפאז'ים במניין ויעוותו בכך את תוצאותיהם.

39 :Escherichia coli גורמי אלימות המוליזינים זוהו 4 המוליזינים: Alpha-hemolysins (hlya) Phage carried hemolysins (e-hlya) Plasmid carried hemolysin (ehxa) Silent hemolysin (shea)

40 :Escherichia coli המוליזינים גורמי אלימות alpha-hemolysins נוצרים על ידי מספר זני.E coli הקשורים למחלת הבצקות ולשלשולים בחזירים ולזיהומים מחוץ למערכת העיכול בבני אדם. רעלן RTX רחב טווח הפוגע בדוריות דם אדומות של מגוון בעלי חיים

41 :Escherichia coli המוליזינים גורמי אלימות phage carried hemolysin או Enterohemolysins ייתכן ואינו המוליזין hemolysin בעצמו אלא גורם לשחרור ה- silent

42 :Escherichia coli המוליזינים גורמי אלימות :Plasmid carried hemolysin רעלן RTX רחב טווח הפוגע בדוריות דם אדומות של מגוון בעלי חיים קשור לחיידקי EHEC

43 :Escherichia coli המוליזינים גורמי אלימות :)Cytolisin A( :Silent hemolysin רעלן יוצר פורים בכד"א שלא ממשפחת ה- RTX נמצא ב- O157-H7 וזני EPEC

44 :Escherichia coli גורמי אלימות Cytotoxic Necrotizing Factors (CNF) במספר קטן של זני.E coli שבודדו ממקרי אלח בעגלים וטלאים נמצא פלסמיד המקודד יצירת רעלן קטלני לחיות ניסוי אך פעילותו המדויקת אינה ידועה. חיידקים אלה נקראים,NTEC Necrotoxigenic E. coli קיצור של שני הרעלנים גורמים לנמק בעור ארנבות בהזרקה ניסויית.

45 :Escherichia coli גורמי אלימות Cytotoxic Necrotizing Factors (CNF) 3 רעלנים בעלי חפיפה גנטית רבה )70%-80%( ביניהם ורעלנים של Yersinia pseudotuberculosis ומיני Bordetella E. coli O78 :CNF1 חלבונים המיוצר על ידי מספר קטן של זני הגורמים לאלח בטלאים, עגלים ועופות.

46 :Escherichia coli גורמי אלימות Cytotoxic Necrotizing Factors (CNF) :CNF2 מיוצר על ידי זני.E coli מעורבים בשלשולים בחיות שונות, תינוקות ומקרי אלח דם וזיהומים בדרכי השתן בבני אדם. יחד עם רעלן זה קיים על הפלסמיד גם גן ליצירת פילי pili( )vir אשר משמעותם הפתוגנית לא ידועה :CNF3 התגלה בבידודי NTEC מבקר וצאן

47 :Escherichia coli סידרופורים גורמי אלימות מנגנונים לקליטת ברזל בנוזלים החוץ תאיים מאפשרים לחיידקי.E coli להתרבות ולשרוד ברקמות )בהם זמינות הברזל נמוכה( עד הגעתם לזרם הדם. זני.E coli הניחנים במנגנונים מסוג זה הם לכן לעתים קרובות פולשניים

48 :Escherichia coli פתוגנזה קיימים עשרות אלפי סרוטיפים של.E coli אך רובם אינם מהווים גורם פתוגני ללא תנאים מסייעים זנים אחרים נחשבים לאלימים במידה זו או אחרת וחולקו למספר קבוצות בהתאם לפגיעה הקלינית ולמנגנונים הפתוגניים שלהם. זנים מסוימים יכולים להשתייך ליותר מקבוצה אחת גם רעלני vero וגם enterohemolysins למשל(. )ליצור

49 :Escherichia coli פתוגנזה מרבית הקבוצות קשורות לתחלואה בבני אדם ומיעוטם בבעלי חיים. מצב זה הוא תוצאה של יותר התעניינות ומשאבים שהופנו לכיוון ההומאני. לא מן הנמנע כי אותן הקבוצות הקשורות כיום לתחלואה בבני אדם בלבד, מעורבות גם בתחלואה בבעלי חיים.

50 :Escherichia coli פתוגנזה חיידקי קולי הפוגעים במערכת העיכול חייבים להיות עמידים לחומציות הקיבה. 3 מערכות Systems) (Acid Resistance ו- AR3, כולם קשורים לשלב הצמיחה זוהו, בניסויי מעבדה, נפרדות: AR2,AR1 הסטאציונארי. סוג המנגנון המופעל תלוי בנוכחות חומרים שונים במצע הגידול. 2 הם מאפשרים לחיידקים אלה לשרוד בחומציות נמוכה עד ph (AR2) או 2.5 ph )השניים האחרים(.

51 Enterotoxigenic E. coli (ETEC) מאופיינים על ידי יצירת אנטרוטוקסינים הצמדות לריריות על ידי פילי אבר היעד שלהם הוא המעי הדק. לקבוצה זו שייכים חיידקי.E coli F5 (K99) בחזירים ו- F4 (K88) בעלי אנטיגנים בעגלים.

52 Enterotoxigenic E. coli (ETEC) שלבי התהליך הפתוגני: הצמדות )adhesion( באמצעות pili לקולטנים )receptors( מתאימים על פני הרירית. יתכן וגם לפוליסכרידים הקפסולאריים תפקיד בתהליך. התרבות ויישוב )colonization( של ריריות המעי הדק הפרשת אנטרוטוקסינים הגורמים לשלשול גיל צעיר, ירידה בחומציות והיעדר נוגדנים ספציפיים על פני ריריות בעל החיים הם גורמים מסייעים לתהליך היישוב

53 Enteropathogenic E. coli (EPEC) נצמדים לרירית המעי וגורמים לשלשולים לא מייצרים אנטרוטוקסינים קבוצה זו, יחד עם חיידקי Verotoxigenic.E coli (AEEC) Attaching and כלולים בקבוצת (VTEC) effacing.e Coli וזאת עקב פעילותם הדומה על אפיתל המעי.

54 Enteropathogenic E. coli (EPEC) הפתוגנזה מתנהלת ב- 3 שלבים: (EPEC קשור לפלסמיד :localized adherence (LA) EAF) adherence factor - המכיל את המידע התורשתי לפילי המתאגדים ביחד pilus bundle forming האחראי גם לקשר בין חיידקים..1 יכולת ההתכווצות של ה- bfp מצמידה את החיידקים זה לזה ולתאי המעי כתוצאה מכך נוצרות מיקרו-מושבות על הרירית מערכת ההפרשה מטיפוס III יכולה לפעול על תאי המעי: שלב 2

55 Enteropathogenic E. coli (EPEC) :signal transduction מתבצע באמצעות מערכת הפרשת חלבונים מטיפוס locus of המידע התורשתי למנגנון זה נמצא על "אי פתוגניות" הנקרא.III.LEE enterocyte effacement באמצעות מערכת זו מוזרקים חומרים שונים ביניהם receptor intimin אשר מתמקם בכרום הציטופלסמי ומשמש לקולטן ל- intimin שמשמש את החיידק להצמדות לתא )שלב 3( הרס microvili לעליה בריכוז הסידן התוך תאי העלייה בריכוז הסידן חוסמת את ספיגת יוני הכלור והנתרן ומגבירה את הפרשת יוני הכלור, ועקב כך גורם להצטברות נוזלים ושלשול. פגיעה ב- junctions tight.2

56 Enteropathogenic E. coli (EPEC) שינויים בשלד התא ייצרת "מעמד" עליו נמצא החיידק המעמד מבוסס על lipid raft ענקי נראה כי יצירת ה"מעמדות" הוא תהליך דינאמי וכי חיידקים יכולים לנצל אותם לשם תנועה על פני האפיתל ה"מעמדות" מאפשרים לחחדק להצמד לרירית

57 Enteropathogenic E. coli (EPEC) קשור ל- intimin :intimate adherence.3

58

59 Enteropathogenic E. coli (EPEC) תופעת השלשול בזיהומי EPEC הנראה במספר תהליכים: קשורה ככל פגיעה ב- microvili הפרעות במאזן אלקטרוליטים תוך וחוץ תאי הגברת חדירות המעי השריית נדידת ניאוטרופילים התרופפות ה- junctions tight בהשפעת חומרים המוחדרים לתא באמצעות מערכת הפרשה מטיפוס III

60 Diffusely Adherent E. coli (DAEC) בנוסף למתכונת ההצמדות שתוארה לעיל,)LA( קיימת גם מתכונת נוספת בה החיידקים מפוזרים על פני כל התא:.)DA( diffuse adherence חיידקים אלה נקראים DAEC ומנגנון ההצמדות שלהם לא ברור אך הם יכולים לגרום לשלשולים. חיידקים אלה עטופים בשלוחות של התאים אליהם הם צמודים )מעין התחלה של פאגוציטיזה( אך הם אינם נבלעים בהם. עטיפות אלה מקנות להם הגנה בפני תרופות אנטיבקטריאליות שאינן חודרות לתאים.

61 Enteroaggregative E. coli (EAEC) לקבוצה זו של חיידקי קולי מתכונת נוספת להצמדות: הם צמודים לפני כל התא כמו ה- DA אך מאוגדים ברבדים בדומה לקיר לבנים, עטופים בשכבת ריר המופרש על ידי התאים בגירוי החיידקים.

62 Enteroaggregative E. coli (EAEC) שלבי הפתוגנזה: הצמדות באמצעות aggregative adherence.fimbriae לאחר ההצמדות מגרים החיידקים הפרשת ריר מוגברת על ידי תאי המעי ויוצרים מעין רובד ביולוגי הכולל בתוכו את שכבות החיידקים.

63 Enteroaggregative E. coli (EAEC) בשלב השלישי מפרישים החיידקים ציטוטוקסין ברירית המעי: קיצור ה- vili necrosis hemorrhagic של קצותיהם תגובה דלקתית מתונה בצקת הפוגע חיידקי EAEC מעורבים בשלשולים הנמשכים מעל 14 בעיקר בארצות העולם השלישי. יום,

64 Enteroinvasive E. coli (EIEC) חיידקים השייכים לקבוצה זו מתרבים באפיתל המעי הגס תוך הריסתו וגורמים לתופעות דומות לדיזנטריה הנגרמת על ידי חיידקי ה- Shigella. הפולשנות של זנים אלה היא ברמת תאי רירית המעי ולא לאברים

65 Enteroinvasive E. coli (EIEC) פתוגנזה: החיידקים חודרים לתאים. החדירה לתא קשורה למערכת הפרשת חלבונים מטיפוס.III המידע התורשתי למערכת זו נמצא על פלסמיד. הורסים את הבועית בה הם מתרבים נמצאים נעים לצדי התא ומדביקים את התאים הצמודים. התנועה בתא נעשית באמצעות הפעלת.actin המידע התורשתי לכך הוא כרומוזומאלי.

66 Enteroinvasive E. coli (EIEC) לשלשולים הנגרמים מקבוצה זו של חיידקי קולי מאפיינים דומים לדיזנטריה הנגרמת על ידי חיידקי :Shigella שלב מימי הקשור אולי להפרשה של רעלנים שלב דזינטרי המאופיין היציאות תכופות עם הפרשה מועטה של צואה דמית ורירית. שלב זה הוא תוצאה של הדלקת החריפה המלווה ביצירת כיבים ברירית המאפיינים את הנגעים הנגרמים על ידי.EIEC

67 Verotoxigenic E. coli (VTEC) Shiga-toxin producing E. coli (STEC) Enterohemorrhagic E. coli (EHEC) קיימת חפיפה ניכרת אך לא מושלמת בין חיידקי הקולי השייכים לקבוצות אלה. הם נבדלים ב: חיידקי VTEC יוצרים רעלנים הפוגעים בתאי VERO )המשמשים לתרביות תאים(. חיידקי STEC יוצרים רעלנים הדומים לאלה המיוצרים על ידי חיידקי.Shigella רעלנים אלה פוגעים גם בתאי VERO אך קיימים גם רעלנים אחרים הפוגעים בתאים אלה. STEC הם לכן תת-קבוצה ב- VTEC. חיידקי EHEC גורמים בבני אדם לתופעות הקליניות אופייניות. היות ולא כל חיידקי ה- STEC או ה- VTEC גורמים לתופעות אלה, הרי שהשימוש בכינוי EHEC צריך להיות שמור לזנים אשר יכולתם לגרום לתופעות קליניות אלה ולכן EHEC הם תת-קבוצה ב- STEC.

68 EHEC STEC VTEC סימנים קליניים יצירת רעלן דמוי Shiga רעלות תאי VERO VTEC STEC EHEC + + +

69 Enterohemorrhagic E. coli (EHEC) המנה המדביקה לבני אדם היא מספר חיידקים בודדים מקור הזיהום הוא לרוב בשר בקר אשר לא קיבל טיפול תרמי מתאים )המבורגרים(. תרד, חסה וחלב לא מפוסטר נמצאו אף הם כמקור לזיהום בני אדם בחיידק קיימת אדם גם אפשרות של העברה בין בני

70 Enterohemorrhagic E. coli (EHEC) מנגנוני הפרשה מטיפוס,III בנוסף לפעילותם בפונדקאי, מאפשרים לחיידק להיצמד לרקמה צמחית וליצור עליה רובד ביולוגי אותו קשה להוריד ומגביר את עמידות החיידק לחומרי חיטוי. כתוצאה מכך עולה הסכנה בהדבקות בחיידק ע"י אכילת ירקות מזוהמים.

71 Enterohemorrhagic E. coli (EHEC) אלימותם של חיידקי STEC מסווגת ב- 5 רמות: גורמת להתפרצויות של זיהומי מעיים ו- HUS SPT-A גורמת להתפרצויות של זיהומי מעיים ו- HUS SPT-B אך לעתים רחוקות יותר מ- SPT-A SPT-C גורמת לזיהומי מעיים ו- HUS ספורדיים SPT-D גורמת לזיהומי מעיים ספורדיים אך לא ל- HUS SPT-E בודדו מבעלי חיים נשאים אך לא מזיהומים בבני אדם גם חיות אחרות )משק ומחמד( נמצאו כנושאות חיידקים מקבוצה זו, והם אף בודדו ממקרי שלשול.

72 Enterohemorrhagic E. coli (EHEC) הפתוגנזה מתבצעת בשני שלבים: בשלב ראשון נצמד החיידק לרירית המעי הגס וקצה המעי הדק )בעיקר לריקמה הלימפתית( בצורה דומה לזו אשר תוארה לגבי.attaching and effacing :EPEC כמוכן מכיל החיידק מנגנון הפרשת חלבונים מטיפוס III פתוגניות בדומה ל- EPEC ואי מנגנון זה מופעל ע"י אדרנלין ו/או הפונדקאי נורדרנלין המופרש ע"י

73 Enterohemorrhagic E. coli (EHEC) קיימים ככל הנראה גם מנגנוני הצמדות נוספים, outer.membrane protein כולל זנים הגורמים למחלת הבצקות בחזירונים לא יוצרים שינויי attaching and effacing אלא נצמדים באמצעות פילוס F18

74 Enterohemorrhagic E. coli (EHEC) בשלב השני, לאחר ההצמדות, החיידקים מתרבים תוך ניצול סוכרים כגון fucose אותם מפרקים חיידקים אחרים משכבת הריר שעל פני תאי המעי. סוכרים אלה, המנוצלים רק במידה מועטה ע"י החיידקים הקומנסלים במערכת העיכול EHEC נותנים יתרון ל- מהווים סמן לחיידקים שהם נמצאים במערכת העיכול שך הפונדקאי.

75 Enterohemorrhagic E. coli (EHEC) לאחר ההצמדות, מפרישים החיידקים את רעלני ה- Stx אשר נספגים לזרם הדם. הרעלן מתקשר לקולטן גליקוליפידי ייחודי Gb3 הנמצא בין היתר בריכוזים גבוהים במעי ובכליות, דבר המסביר את התופעות הקליניות הקשורות בחיידק במעי גורם הרעלן lamina לדימומים ובצקת ב- propria מוקדי נמק וריכוז ניאוטרופילים

76 Enterohemorrhagic E. coli (EHEC) בבקר החיידק מיישב ומתרבה בעיקר ברירית החלחולת הוא מפריש חומרים נוגדי דלקת ומעכבים תגובה חיסונית נוכחותו אינה גורמת לתופעות קליניות מאפשר את פיזורו בסביבת החיה.

77 שילוב pathotypes 39 מתים( ב אירעה התפרצות גדולה )מעל 3000 של תחלואת מעיים ו- HUS בגרמניה חולים, מקור ההדבקה היו כנראה חילבה שמקורו במצריים תחילה חשבו שמדובר ב- EHEC אך המאפיינים האפידמולוגיים והקליניים לא תאמו זאת: היה אחוז גבוה מאד )25%( של מקרי HUS )לעומת צפי של כ- 6% ( הנפגעים היו בעיקר מבוגרים עם היארעות כפולה בנשים מאשר בגברים החיידקים היו מאד יציבים לתכשירים אנטיבקטריאליים

78 שילוב pathotypes בבדיקה גנטית הסתבר כי לא נמצאו הגנים הדרושים ל- attaching/effacing נמצאו גנים ליצירת רעלני Shiga-like נמצאו הגנים לצמיחה בצורה enteroaggregative נראה, לכן, כי לא מדובר ב- EHEC אלא ב- EAEC Shigalike אשר רכש את המידע התורשתי ליצירת רעלני והיציבות לממצא זה השלכות אפידמיולוגיות מרחיקות לכת היות ו- EHEC מקורו בבקר בזמן ש- EAEC מקורו בבני אדם

79 Avian pathogenic E. coli (APEC) מגוון סרוטיפים אבל 3 נחשבים למשמעותיים ביותר: O1 O2 O78 בדומה לחיידקי.E coli שבודדו מזיהומי עטין בבקר, גם ל- APEC אין מאפיינים משותפים ברורים

80 Avian pathogenic E. coli (APEC) ניתן למצוא סרוטיפים פתוגניים במעי של עופות בריאים )10%-15%( קיימת אפשרות של העברה אופקית של גנים אשר יהפכו זנים לא אלימים לאלימים העברה אופקית של גנים יכולה להסביר גם את השונות הגבוהה בין זני APEC

81 Avian pathogenic E. coli (APEC) הפרשת החיידק בצואה מהווה, הדבקה באמצעות אבק לאחר ייבושה, מקור יש לשער שלזיהום קליני הכולל מעבר לאברים יש צורך בגורמי סיכון, בעיקר עקה (stress) מנגנונים דומים קיימים בזנים expec בבני אדם

82 פתוגנזה: סיכום

83 :Escherichia coli תמונה קלינית חיידקי.E coli מעורבים במגוון תסמונות בבעלי חיים ובני אדם: מחלות של מערכת העיכול אלח כללי פגיעה באברים שונים כגון פרקים, המח. זיהומים של דרכי השתן דלקות רחם דלקות עטין קרום ריאות,

84 :Escherichia coli תמונה קלינית מערכת העיכול

85 תמונה קלינית בעגלים: ETEC זני ה- ETEC.(K99) F5 הנפוצים ביותר בעגלים הם בעלי אנטיגן F41 אנטיגנים פימבריאלים נוספים: ו- F17 זני ה- ETEC הגורמים לזיהומים בעגלים אינם המוליטיים ואינם פולשניים )מבודדים רק מהמעי(.

86 תמונה קלינית בעגלים: ETEC רגישים ביותר עגלים עד גיל יומיים אך הדבקה ניסויית בדרך כלל לא מצליחה מעבר ל- 24 השעות הראשונות לחיי העגל. השלשולים הם חריפים במיוחד ונגמרים לעתים קרובות, טיפול אנטיבקטריאלי, במות בעל החיים. התמותה מחיידקים אלה בישראל, שכיחה יחסית בעבר, הצטמצמה למספר מקרים בשנה עקב מדיניות של חיסון אימהות/מתן נוגדנים. למרות

87 תמונה קלינית: ETEC חזירים: זני ה- ETEC הנפוצים ביותר בחזירים הם בעלי אנטיגן ו- ad. ac,ab :serotypes ומבדילים בשלושה (K88) F4 בניגוד לעגלים, חזירונים רגישים לחיידק עד גיל מספר שבועות אך בשבועיים הראשונים לחייהם הם בסיכון הגבוה במיוחד. זני F4 הם פולשניים )ניתן לבודד אותם ממרבית אברי החזירונים( והמוליטיים. בני אדם: traveler's ( גורם בבני אדם ל"שלשול נוסעים" ETEC.)diarrhea

88 תמונה קלינית: VTEC, STEC, EHEC זוהו מעל 100 סרוטיפים של EHEC מהם כ- 60 מעורבים בזיהומים בבני אדם. חמישה סרוטיפים הם בעלי אלימות מוגברת: O26 O145 O103 O111 O157-H7 הוא הסרוטיפ העיקרי אשר גורם להתפרצויות קשות מלוות תמותה בבני אדם.

89 Enterohemorrhagic E. coli (EHEC) זני O157:H7 נבדלים גנטית מזני EHEC אחרים וקרובים יותר לזן.EPEC O55:H7 מניחים שזן ה- EHEC רכש באמצעות פאז' את הגן ליצירת,STX2 אנטיגן O157 והפלסמיד.pO157 קוים: אחד שאיבד אנזימים מסוימים כגון זה שמאפשר לו לנצל סורביתול ורכש את הפאז' STX2 השני, שכיח במרכז אירופה, שאיבד את יכולת התנועה שלו. זוהו 2

90 Enterohemorrhagic E. coli (EHEC) נמצא שקיימים מספר קווים גנטיים )לפחות 5( O157-H7 לסרוטיפ קיימת שונות בחלוקה הגיאוגראפית בשכיחות זיהומי בני אדם בחיידקי קולי O157-H7 )בישראל יש מקרים בודדים( בקווים הגנטיים השונים.

91 Enterohemorrhagic E. coli (EHEC) נמצא ששני קווים גנטיים הם האחראים כמעט לכל מקרי הזיהום בבני אדם - כתוצאה )כך מניחים( ממאפייני אלימות מיוחדים. מכאן שבידוד סרוטיפ זה מבקר לכשעצמו אינו מספיק על מנת להסיק מסקנות באשר לסכנת ההדבקה לבני אדם אלא יש לבדוק את המאפיינים הגנטיים של הזן.

92 תמונה קלינית: VTEC, STEC, EHEC המנה המדביקה לבני אדם נמוכה מאד CFU נמצאים לפעמים במערכת העיכול של בני אדם ללא סימנים קליניים קליניקה מאופיינת על ידי 2 שלבים: attaching and השלב הראשון קשור לתהליכי ה- effacing ומאופיין על ידי שלשול מימי. יש מקרים בהם זנים שחסרים את הגן לשלב זה -LEE מסוגלים לגרום לתסמונת הקשורה לשלב השני.

93 תמונה קלינית: VTEC, STEC, EHEC בשלב השני, עם יצירת ה- Stx מתחיל hemorrhagic colitis,)hc( המתבטא בשלשול דמי. תסמונת זו יכולה להתפתח, בעיקר באנשים צעירים וזקנים, לתסמונת אחרת:,)HUS( hemolytic uremic syndrome הכוללת אי ספיקת כליות חריפה, אנמיה וטרומבוציטופניה. תסמונת זו קטלנית לעתים קרובות. נראה כי התסמונות קשורות ביכולת הרעלן להפר את המאזן בין מנגנונים הגורמים לקרישת דם לבין אלה המונעים אותו ברמת האנדותל. בנוסף, נראה כי Stx2 המרכזית. גם פוגע ישירות במערכת העצבים

94 תמונה קלינית: VTEC, STEC, EHEC מחלת הבצקות בחזירים, הנגרמת אף היא מחיידקים השייכים לקבוצה זו, מתבטאת בבצקות באברים שונים, בעיקר במערכת העיכול אך גם במוח. היא מלווה לכן גם בסימנים עצביים. STEC בודד גם ממקרי שלשול בחיות אחרות אך משמעותו הקלינית לא ידועה

95 E. coli תמונה קלינית: קבוצות אחרות של ידוע מעט על השלשול הנגרם מחיידקי.E coli אחרים בחיות נמצא יחס ישיר בין איכות הממשק הקולוסטרלי לשכיחות וחומרת זיהומים ב- coli.e EPEC גורם לשלשולים בעיקר בתינוקות בעולם השלישי

96 E. coli תמונה קלינית: קבוצות אחרות של EPEC נמצא יותר בעגלים בריאים מאשר בעגלים משלשלים גנים הקשורים ל- DAEC אבל לא EAEC לעתים יותר קרובות בעגלים משלשלים נמצאו CNF והמוליזינים נמצאו לעתים יותר קרובות בעגלים משלשלים מאשר מעגלים בריאים קיימת אפשרות חיות ישמשו כמקור להדבקת בני אדם

97 :Escherichia coli תמונה קלינית מצבי אלח

98 תמונה קלינית: מצבי אלח (sepsis) חיידקי.E coli מסוימים האנטיגן הסומאטי O78( חיות צעירות )הבולט שביניהם הוא בעל עוברים בקלות את דופן המעי של יכולתם לגרום למצבי אלח תלויה ביכולת המערכת החיסונית להתמודד עם הזיהום. התכונה העיקרית המייחדת זנים אלה של חיידקי.E coli היא יכולתם לשחרר ברזל ברקמות. בנוסף לאלימות החיידק, קשור אלח מ- coli.e קרובות גם בממשק קולוסטראלי לקוי. לעתים

99 תמונה קלינית: מצבי אלח (sepsis) התמונה הקלינית משתנה: החל מתמותה מהירה ללא סימנים קליניים כתוצאה מ- shock endotoxic וכלה בסימנים פתולוגיים טיפוסיים של אלח כגון petechiae פזורים על אברים שונים

100 :Escherichia coli תמונה קלינית פגיעה באיברים שונים

101 תמונה קלינית: פגיעה באברים ספציפיים בניגוד למצבי אלח בהם החיידק מפוזר בכל הגוף, קיימת אפשרות פגיעה באבר אחד או יותר, עם סימנים קליניים מתאימים )דלקת ריאות, דלקת קרום המח עם סימנים עיצביים, דלקת פרקים וכו'(.

102 :Escherichia coli תמונה קלינית זיהומים בדרכי השתן

103 תמונה קלינית: זיהומי דרכי השתן זנים מסוימים של חיידקי (O2, O4, O6, O83) E. coli הקראים,UPEC קיצור של,Uropathogenic E. coli מעורבים בזיהומי דרכי השתן של חיות שונות ובני אדם. גורם הזיהום עולה בדרך כלל דרך השופכה. לזנים אלה יכולת הצמדות לריריות דרכי השתן, השלפוחית, באמצעות פילי. בעיקר

104 תמונה קלינית: זיהומי דרכי השתן היות ולשתן יש פעילות אנטיבקטריאלית, יש צורך בגורמים מסייעים לזיהום דרכי השתן ב- coli.e. גורמים אלה יכולים להיות קשורים בשינויים אנטומיים )רב המקרים הם אצל נקיבות עקב הפתח הגדול יותר של השופכה(, שינויים בתכונות )בעיקר חומציות( השתן )עקב הזנה לא נכונה למשל( הפרעות בהטלת שתן )אבנים למשל(.

105 תמונה קלינית: זיהומי דרכי השתן בזיהומים חמורים גורמים החיידקים גם לזיהומים קשים בכליות. במקרים אלה, מתרבים וממלאים חיידקי ה-.E coli את צינוריות הכליה ונוצרים גושים גליליים של חיידקים (casts) אותם ניתן למצוא בשתן.

106 :Escherichia coli תמונה קלינית דלקות רחם

107 תמונה קלינית: דלקות רחם.E coli הוא אחד הגורמים הזיהומיים שיכולים להיות מעורבים בדלקות רחם בחתולות וכלבות. דלקות אלה מופיעות לעתים לאחר טיפולים הורמונאליים נגד ייחום, הפוגעים בפעילות המערכת החיסונית ברחם.

108 :Escherichia coli תמונה קלינית דלקות עטין

109 תמונה קלינית: דלקות עטין דלקות עטין מ- coli.e )כמו גם מחיידקי מעיים אחרים( יכול להופיע בצורות קליניות שונות, מתת קליניות ועד חריפות ביותר, מלוות סימנים סיסטמיים )עליה בחום, חוסר תיאבון, דיכאון וכו'(. התהליך הדלקתי יכול גם להפך לנמקי. בישראל מהווים כיום "קוליפורמים" אחד הגורמים הזיהומיים השכיחים ביותר בדלקות עטין

110 תמונה קלינית: דלקות עטין תרם נמצאו הבדלים בין חיידקי ה-.E coli המבודדים מדלקות עטין לזנים צואתיים ולכן מניחים כי דלקות אלה נגרמות לאחר חדירת החיידקים דרך הפטמה עקב היגיינה ירודה, מערכות חליבה לא תקינות או פגמים אנטומיים. מחקרים לזיהוי הבדלים כאלה מתנהלים כיום, בישראל גם

111 תמונה קלינית: דלקות עטין התופעות הקליניות קשורות בעיקר לפעילות האנדוטוקסינים וניתן לשחזרם ע"י הזרקת רעלנים אלה ללא חיידקים, לעטין. הסימנים הקליניים הסיסטמיים קשורים להתפשטות האנדוטוקסינים מהעטין. טיפול אנטיבקטריאלי גורם להרס החיידקים, אנדוטוקסין והחמרת הדלקת. הגברת שחרור רעלן נוסף, רגיש לחום וציטוטוקסי, בשכבות העליונות של הסינוסים. אחראי לנמק התאים

112 פיתוח תרכיבים על מנת שתהיה כדאיות לפתח תרכיבים לבעלי חיים צריכים להתקיים מספר תנאים: מחיר אוכלוסיית יעד ברורה גורם מוגדר שיקולים נוספים )אבחון וכו'(

113 חסינות וחיסונים המאמצים לפיתוח תרכיבים נגד זיהומי.E coli הופנו בעבר בעיקר לכיוון ה- ETEC, וזאת בעיקר עקב פעילותם הספציפית המוכרת היטב ואוכלוסיית יעד מוגדרת ורחבה דיה. מרבית התרכיבים מבוססים על חיסון אימהות והעברת נוגדנים דרך הקולוסטרום. הנוגדנים הנוצרים הם נגד הפילי ובכך נמנעת הצמדות החיידקים לריריות ועל ידי כך גם פעילותם הפתוגנית.

114 חסינות וחיסונים היות ובעלי החיים, בעיקר עגלים, נמצאים בסיכון למשך זמן קצר בלבד לאחר ההמלטה )24-48 שעות( מספיק מתן הנוגדנים בקולוסטרום למנוע את המחלה. חשוב לציין כי הנוגדנים בתרכיב אינם הורגים את חיידקי ה-.E coli אלא רק מונעים את היצמדותם לרירית המעי. ניתן, לכן, לבודד ETEC גם מבעלי חיים אשר טופלו בנוגדנים.

115 חסינות וחיסונים ההתפרצויות הקשות בבני אדם אשר נגרמו ע"י חיידקי EHEC הביאו למאמצים לפתח תרכיב נגד pathotype זה הכוונה לחסן לקראת השחיטה ובכך לצמצם את מטען החיידקים ועקב כך את סכנת הזיהום

116 חסינות וחיסונים המשתתף נוסו תרכיבים תת-תאיים כגון כאלה המבוססים על גן LEE בהצמדת החיידק לריריות סידרופורים חלבוני קרום התא חלבונים רקומבינאנטים תרכיבים אלה צמצמו אך לא מנעו את תופעת הנשאות כמות החיידקים המופרשים

117 חסינות וחיסונים נעשו נסיונות לחסן עופות נגד APEC באמצעות זנים מומתים, ממויירים ומוטנטים ורכיבים תת- תאיים ההגנה הייתה מוגבלת לזן התרכיב ו/או קצרת מועד היות וקיימת שונות בפתוגנזה של סרוטיפים שונים יש צורך בפיתוח תרכיבים פוליוולנטיים

118 טיפול קיימת שונות רבה ברגישותם של חיידקי.E coli אנטיבקטריאליות. לתכשירים חשוב לכן לבצע מבחן רגישות לפני תחילת כל טיפול. לאור תופעות הלוואי החריפות לטיפול אנטיבקטריאלי בדלקות עטין מ- coli.e מבוסס הטיפול במקרים אלה בעיקר על חליבות תכופות להרחקת החיידק. הטיפול בזיהומי EHEC בבני אדם בעייתי במיוחד עקב הגברת אלימות החיידקים ע"י תכשירים אנטיבקטריאלים מסויימים

119 טיפול לאחרונה התפשטו חיידקי.E coli )וחיידקי מעיים אחרים, בעיקר spp. )Klebsiella בעלי יציבות מורחבת כולל לצפלוספורינים מהדור ה- III : extended spectrum beta lactamses-esbl. למרות שההדבקה קשורה לבתי חולים, חיות שונות יכולות לשאת חיידקי.E coli אלה ומהוות סיכון להדבקה זואונוטי. היות וזנים אלה אינם מותאמים לחיות, הם מועברים גם מאדם לאדם ומאדם לחיות. שכיחותם של זנים אלה יחסית גבוהה בישראל

120 זיהוי מעבדתי: משמעות התרבית עקב נפיצות החיידק חשוב לדעת האם הבידוד קשור לקליניקה לשם כך יש לבחון: האם חיידקי הקולי הם המרכיב הדומיננטי בתרבית האם צומחים מספר רב של מושבות )בתלות למקור הבידוד(

121 זיהוי מעבדתי - פנוטיפ.E coli צומח מהר על כל המצעים המקובלים ובצורה אופיינית על מצע.McConkey ל- pathotypes מסוימים תכונות אופייניות: sorbitol הוא O157:H7 שלילי rhamnose הוא 26-O שלילי פרופיל ביוכימי

122 זיהוי מעבדתי: סרוטיפיזציה לזהות האם הבידוד שייך לאחד הזנים הידועים כפתוגניים. לשם כך יש לגדלם על מצעים מיוחדים ולבצע זיהוי סרולוגי. O78 E. coli בצורה זו ניתן לזהות,ETEC ראשוני של.O157 E. coli חיובי ואף זיהוי Slide-agglutination

123 זיהוי מעבדתי: גנום מגוון שיטות לזיהוי גנים ספציפיים לכל.pathotype מאפשרים לזהות גם גנים אחראים ליציבות לתכשירים אנטיבקטריאליים.

124 זיהוי מעבדתי זיהוי סופי של בידודים החשודים כמעורבים בתהליכים פתולוגיים נעשה במעבדות המתמחות בכך )משרד הבריאות בירושלים( בעלות גבוהה ולוקחות זמן רב. זיהוי כזה נעשה לכן במקרים בהם יש לכך חשיבות קלינית.